分子是保持物质化学性质的最小粒子。原子是化学变化中的最小粒子。分子与原子都是构成物质的一种粒子，质量和体积都非常小，彼此间有间隔，在不停地运动，都既有种类之分，又有个数之别，都不显电性。分子总是在不断的运动。
分子的概念及其特性
从概念上看，分子是保持物质化学性质的最小粒子。同种分子，性质相同，不同的分子，性质不相同。这里的性质特指“化学性质”，而不是物理性质。因为物理性质是大量分子聚集在一起才能体现出来的性质，单个分子无法体现。
分子并不是保持物质化学性质的唯一粒子，因为原子、离子也能保持物质的化学性质。这要根据具体的物质来分析：
如果物质是由分子构成，则分子就保持该物质的化学性质;如水、氧气、氮气等是由分子构成的物质，则保持它们化学性质的粒子分别为水分子、氧分子、氮分子。
如果物质是由原子直接构成的，则原子就保持它们的化学性质。如保持汞的化学性质的是汞原子，保持氦气的化学性质的是氦原子。
如果物质由离子构成，则离子就是保持物质化学性质的粒子。如保持氯化钠化学性质的粒子是氯离子和钠离子。
分子的特性是质量小，体积小;分子总是在不断运动的，而且温度越高，分子的能量越大，运动速率就越快;分子之间都有间隔，而且间隔大小与物质所处的状态有关，还与温度和压强有关。一般来说，温度越高，分子间的间隔越大;压强越大，分子间的间隔越小。
原子的概念及其特性
从概念上看，原子是化学变化中的最小粒子，即是用化学方法不能再分的粒子。也就是说用其他方法还能将原子再分。原子还能分成质子、中子和电子。
化学变化的实质是：构成反应物的分子先分裂成原子，所有的原子又重新结合成新的分子或者直接构成新的物质。在整个过程中，分子的种类一定发生了改变，原子的种类、数目和质量都没有发生改变，分子的数目可能发生改变。
原子的特性：原子的质量和体积也很小;原子也在不断运动，其运动速率与温度有关;原子之间也有间隔，原子间的间隔也与温度和压强有关，其变化规律与分子的变化规律一致。
原子的结构
原子是由原子中心的原子核和核外电子构成。原子核由质子和中子构成，质子带正电，核外电子带负电，质子数和核外电子数相等，所以原子不显电性。原子的质量主要集中在原子核上，与质子、中子相比，电子的质量很小，是质子质量的1/。
1、核外电子的运动状态——分层运动
①分层运动：含有多个电子的原子中，由于各电子的能量不同，克服原子核对其引力的能力各不相同，因而分布在离核远近不同的区域运动。
②分层原理：能量低的电子在离核近的区域运动;能量高的电子在离核远的区域运动。
③电子层的划分：根据电子离核的远近分为1~7个电子层，离核最近的叫第一层，依次为第二层，直到第七层。
2、核外电子排布规律
①核外电子总是尽量排布在能量较低的电子层里，然后再由里向外排。
②各电子层最多容纳的电子数目为2n2(n为第n电子层数)。
③最外层电子最多不超过8个电子(当第一层为最外层时，不超过2个电子)，次外层不超过18个电子。
3、离子的形成
元素的原子由于最外层电子数未达到8个电子(第一层为2个)的稳定结构，在化学反应中易失去或得到电子，使最外层达到稳定结构，从而形成阳离子或阴离子。离子的分类：
阳离子：带正电的离子;阴离子：带负电的离子。
(1)原子与离子的区别与联系
(2)原子最外层电子数与其化学性质的联系
原子的最外层电子数决定元素的化合价。一般地，原子最外层电子数小于4个的，在化学反应中易失去电子，其元素的化合价表现为正价，失去1个电子，是+1价：失去2个电子，是+2价。失去最外层电子数即是最高正价。
原子最外层电子数多于4个的，在化学反应中易得到电子，元素的化合价表现为负价，得到1个电子，是-1价：得到2个电子，是-2价。直到最外层电子数满8个(第一层为2个)，得到几个就是负几价。
分子和原子的区别与联系
区别：分子在化学变化中可以分成原子，原子在化学变化中不能再分。
联系：分子可以分裂成原子，原子又可以构成分子，原子还能直接构成物质。分子也能构成物质，分子、原子都是构成物质的粒子。原子是化学变化中的最小微粒，化学变化的实质就是原子的重新组合。(如下图)
①说明：原子构成分子;
②说明：分子构成物质，如碳原子和氧原子构成二氧化碳分子，二氧化碳分子构成二氧化碳;
③说明：原子可直接构成物质，如铁原子构成铁，氦气由氦原子构成;
④⑤说明：同类的原子总称为元素，而元素又组成物质。
原子、分子和离子构成的物质
1、由原子直接构成的物质
①金属单质(Na，Cu，Fe)
②一些非金属单质和化合物(C，S，O2)
③稀有气体(He，Ne，Ar，Kr)
2、由分子构成的物质有
①某些气态非金属单质，如：O2，H2，N2，Cl2。
②某些共价化合物，如：CO2，H2，C2H5OH。
3、由离子构成的离子化合物
如：NaCl，KCl，NaOH，K2SO4。
分子和原子概念的应用
在运用原子和分子的概念时，必须注意以下几方面问题。
1、分子是保持物质化学性质的一种微粒而不是唯一微粒
如果某种物质是由分子构成的，它的化学性质就是由分子保持的。如氧气的化学性质就是由氧分子保持的。如果某种物质是由原子直接构成的，它的化学性质就是由原子保持的。如铁的化学性质就是由铁原子保持的。
2、分子只能保持物质的化学性质而不能保持物质的物理性质
物质的物理性质，如熔点、沸点、密度、硬度、延展性等，都是大量分子的聚集体所表现的属性。物理性质所指的是宏观现象，它不能由单个分子表现出来。例如:单独存在的分子就不能用固态、液态或者气态来描述，而同种物质的分子都有相同的化学性质。
3、原子不一定比分子小
分子与构成这一种分子的原子比，原子比分子小。如氧分子一定比氧原子大。但并不是说原子都一定比分子小，如果分子是由单原子构成的(如稀有气体分子)，分子的大小与构成它的原子的大小相同;如果分子与其它原子相比，则分子有可能比原子小，如氧分子就比汞原子小。
4、物质不都是由分子构成的
分子只是构成物质微粒中的一种。有的物质是由分子构成的，如氧气、二氧化碳等;有的物质是由原子构成的，如铁、金刚石等;有的物质是由离子构成的，如氯化钠等。
5、原子“不能再分”是有前提条件的
原子是用化学方法不能再分的微粒，也就是说，如果离开了“化学变化”这个前提条件，则分子、原子都是可分的。分子可以分成原子，而原子又可以分成质子、中子、电子等。如原子弹爆炸和原子能的利用，都是原子核裂变释放的能量，即在一定条件下，原子可以再分，但它们不属于化学变化的范畴。