在制药和化工企业废水处理过程中，会遇到各种难题。在处理方法上不断创新，从本质上来看，无非是增效降本。而在废水中的各种污染物，要有差异的进行处理。根据污染物的种类和性质，应当明确其对应方法。但是，废水中的污染物并非那么单独。不能明确各种化合物之间的作用，就不能有效清除污染。从污染物成分上来讲，引入催化剂或反应物质，是为了降低和转化污染物。如果不清楚多种污染物之间的关联，很可能引狼入室，污染物不减反增，得不偿失。比如，在废水中的重金属离子，希望能够全部除去，是比较难的，可以降低到规定的标准限制以下。
制药化工废水中的重金属离子，大致上来说，主要有汞、镉、铬、铅、钒、钴、钡等，其中汞、镉、铅危害较大；砷、硒和铍的毒性也较大。重金属离子的危害是有目共睹的，能够在食物链的末端不断积累。如果人吃了有重金属的食物，就会残存在体内，容易引起疾病和中毒。少量的重金属，也可能引起慢性病的发展。废液中的重金属离子污染物，占据工业排放污染物的一大部分。在这个方面，对企业的要求是非常严格的。重金属离子的种类根据厂家，种类，生产工艺的不同。它的含量和比例也是千差万别的，需要仔细斟酌，逐步降解转化。
废水中的重金属污染物处理方法大致可以分为以下几种
1.化学沉淀法
通过加入可以和废水中重金属进行化学絮凝的物质，通过静置或离心的方法，进行快速分离，实现重金属离子脱除的方法。化学沉淀方法，主要是将废水中的离子状态，转变为难溶解的物质，比如硫化物，碳酸盐沉淀等。处理废水重金属离子是有要求的，比如采用加热的方式，使得废水温度达到反应条件，能够更全面的进行反应。也可以在废水中添加多种氧化或还原剂，调节pH值，浓度调整等。最终是为了能够有效除去或降低重金属离子浓度。化学沉淀的方法在废水处理中，应用比较广泛，处理效果也比较明显。
2.电化学法
电化学法是利用电极的作用，使得重金属离子能够按照预期的规定进行迁移。在此过程中，发生氧化还原反应，从而脱离重金属离子。在整个过程中，需要消耗电能。所以，如果要大量废水进行反应，消耗电能就比较高了。电化学法在重金属离子回收方面，应用比较广。在反应的过程中，为了增加处理效率，往往会添加一下催化剂等。
3.吸附法
吸附的原理主要是靠静电作用，将重金属离子从废水中脱离出来，黏着在吸附剂上。吸附方法在制药和化工废水处理中，使用也比较广。常见的吸附剂有活性炭，沸石，石墨烯等。具有操作方法，需要在工艺中判断和选择使用。
4.离子交换法
通过加入特定的物质，使得废水中的重金属离子和这种物质进行离子交换，从而达到脱离重金属的目的。离子交换法在废水中的铬、铜、镍、铅、锰、汞等方面，使用相对比较多。离子交换法在废水处理中，效果相对比较明显。在未来污废水的处理中，有非常广大的发展空间。常用的离子交换剂有交换树脂或交换膜等。